Le troisième cycle de la faculté de théologie prépare à la rédaction et à la soutenance d’une thèse de doctorat canonique en théologie.
La formation doctorale est ouverte aux étudiants de toutes nationalités titulaires d’une licence canonique en théologie (d’une mention égale ou supérieure à cum laude), tant laïcs que religieux ou clercs. Elle s’effectue principalement par l’élaboration et la rédaction de la thèse sous la direction d’un professeur de la Faculté, et par la participation à des séminaires méthodologiques, thématiques et de recherche, à des journées doctorales et à des colloques.
La durée des études est de quatre ans à temps plein, sauf dérogation. Après la soutenance publique, l’approbation et la publication de sa thèse, l’étudiant reçoit le diplôme de docteur en théologie. Pour être approuvée, la thèse doit contribuer au progrès de la théologie dans un de ses domaines : l’exégèse, la dogmatique, la morale, la théologie fondamentale et pastorale.
Le 3e cycle comporte habituellement 4 années (sauf dérogation du Conseil Académique). Durant celles-ci les étudiants participent, chaque année, à 3 journées doctorales et aux séances du séminaire transversal entre autres.