Les certificats en « Histoire & Sciences des Religions, Culture et Sociétés », « Sciences des Religions » et « Histoire de l’Eglise » constituent trois manières différentes d’interroger les phénomènes religieux dans leur diversité. Si le Certificat en Histoire de l’Église s’organise autour de l’analyse détaillée des évolutions dans le temps d’une seule religion (le christianisme), le Certificat en Histoire des Religions, Cultures et Sociétés aborde quant à lui les religions abrahamiques et non-abrahamiques en mettant en évidence la différence de leurs expressions historiques et culturelles ; le Certificat en Sciences des Religions multiplie pour sa part les approches disciplinaires des phénomènes religieux afin de leur restituer toute leur complexité constitutive.